ICT meets biotech

[AOS]

Het is niet echt nieuws, maar wel belangerijk .

 

 

http://www.computable.nl/artikels/buitlan2/i1202squ.htm

 

Programmeurs:

zie bijvoorbeeld ook:

www.biopython.org

www.biojava.org

www.bioperl.org

www.bioxml.org

 

Algemeen:

bijvoorbeeld:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

 

 

 

[AOS]

Hier trouwens ook nog een aardige link.

 

http://www.technologyreview.com/articles/innnovation60502.asp

 

Open-source programming created a revolution in operating systems, making Linux a popular alternative to Microsoft’s Windows. The idea—to make software source code open for modification by anyone—has caught on in large part because more eyes on the software means rapid improvements and fewer bugs; companies like Red Hat have turned the idea into profits by selling easily installed, well-supported versions of Linux. Now Cape Town, South Africa-based Electric Genetics is, for the first time, applying that business model to biomedical software.

 

Zou een dergelijk business-model werken of niet?

 

Voor zover ik weet, laten de licenties voor het gebruik van Biojava, Biopython e.d., overigens toe dat er closed-source applicaties mee geschreven en (met winst) verkocht worden.

 

[zrski]

Volgens mij moeten er wel mogelijkheden zijn. Opensource consultancy en support zijn vaak de "money makers" voor opensource bedrijven.

 

Wat ik me afvraag is, kan je gewoon thuis met bio-ict aan de slag???

 

[AOS]

 

 

Wat ik me afvraag is, kan je gewoon thuis met bio-ict aan de slag???

 

 

Dat vraag ik me ook af.

Je kunt er uiteraard thuis mee aan de slag (leren, uitproberen, ontwikkeling) net zoals C++, Java of wat dan ook. Een (goede) internet verbinding is denk ik op een gegeven moment wel handig omdat veel van de data die je wilt bewerken via het internet toegankelijk zijn.

 

Voorbeeld: biopython kun je gewoon op een computer installeren als je daar al een python-interpreter op hebt staan. Hetzelfde geldt, neem ik aan, ook voor de andere talen.

 

Als bedrijf: dat ligt denk ik heel erg aan de diensten/producten die je wilt leveren. Ik heb er grote twijfels bij als men dat gewoon op een studeerkamer zou doen en ook in je eentje. Tenzij je je aanbiedt als puur programmeur.

Ik denk dat je meer aan een bedrijf moet denken met bio(techno)logen, programmeurs, netwerkspecialisten en wat maar nodig is voor de diensten/producten die je levert.

[AOS]

And the story continues....

 

http://www.bio-itworld.com/archive/061202/class.html

 

 

[AOS]

Weer even een bericht uit Bioinformaticaland

 

Hoewel veelbelovend, is de Bio-IT niet iets waarmee je even snel geld kan verdienen.

Bio-IT firms get nowhere - in a rush

 

 

This is the story of the gold rush that wasn't.

 

 

It has a bit in common with the gold rush that was - the Internet frenzy of the late 1990s. But it's also different, because it took place in the early 2000s, and a gold rush is a lot less fun when there's not much gold to go around.

 

 

lees meer op:

 

http://www.boston.com/dailyglobe2/301/business/Bio_IT_firms_get_nowhere_in_a_rush+.shtml

[Jeroen Bakker]

Voor degenen die te snel doorklikken op de link in de post van AOS hierboven en niet meer snappen waar ze zijn, zoals ik in eerste instantie, dit is de link helemaal:

 

Bio-IT firms get nowhere - in a rush

 

Interessante materie trouwens, moet eerlijk zeggen dat de discussie tot nu toe een beetje langs me heen is gegaan. Zijn er (veel?) Nederlandse bedrijven hierin actief?

[AOS]

Voor degenen die te snel doorklikken op de link in de post van AOS hierboven en niet meer snappen waar ze zijn, zoals ik in eerste instantie, dit is de link helemaal:

 

Bio-IT firms get nowhere - in a rush

 

Interessante materie trouwens, moet eerlijk zeggen dat de discussie tot nu toe een beetje langs me heen is gegaan. Zijn er (veel?) Nederlandse bedrijven hierin actief?

 

Bedankt voor het geven van een correcte link! Ik heb hem zelf ook maar even voor de goede orde aangepast.

 

Er zijn zeker een paar Nederlandse bedrijven die ook bioinformatica producten of diensten leveren, maar ik neem aan dat al met al het op een hand te tellen is.

 

Desondanks verwacht men, met de hoeveelheid aan genomen die gesequenced wordt, en zeker ook de hoeveelheid dat nog gesequenced gaat worden, dat de vraag naar bioinformatica behoorlijk zal toenemen. Domweg om met al deze data ook wat te gaan doen. Het sequencen van een genoom levert je namelijk niets anders op dan een hele zooi A, C, T en G's.

Ook wordt er een behoorlijke krapte op de arbeidsmarkt voor bioinformatici verwacht.

 

En dan heb je het alleen over DNA-gerelateerd Bio-IT. Daarbij komt nog de ontwikkelingen in het maken van 3D-modellen voor eiwitten. De automatisering die eventueel nodig is voor hoge throughput screening (m.a.w. heel veel testjes in korte tijd), en er zijn vast ook nog wel andere dingetjes.